### R code from vignette source 'vignettes/ExiMiR/inst/doc/ExiMiR-vignette.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: ExiMiR-vignette.Rnw:399-402 ################################################### library(ExiMiR) data(cdfenv) data(GSE19183) ################################################### ### code chunk number 2: ExiMiR-vignette.Rnw:405-406 ################################################### eset.rma <- rma(GSE19183) ################################################### ### code chunk number 3: ExiMiR-vignette.Rnw:409-410 ################################################### eset.spike <- NormiR(GSE19183, figures.show=FALSE) ################################################### ### code chunk number 4: ExiMiR-vignette.Rnw:420-423 ################################################### library(ExiMiR) data(galenv) data(GSE20122) ################################################### ### code chunk number 5: ExiMiR-vignette.Rnw:427-428 ################################################### eset.rma <- rma(GSE20122, background=FALSE) ################################################### ### code chunk number 6: ExiMiR-vignette.Rnw:431-432 ################################################### eset.spike <- NormiR(GSE20122, figures.show=FALSE)