################################################### ### chunk number 1: chunk1 ################################################### #line 239 "vignettes/DAVIDQuery/inst/doc/DAVIDQuery.Rnw" library("DAVIDQuery") result = DAVIDQuery(type="UNIPROT_ACCESSION", annot=NULL, tool="geneReportFull") names(result) ################################################### ### chunk number 2: chunk2 ################################################### #line 253 "vignettes/DAVIDQuery/inst/doc/DAVIDQuery.Rnw" Sys.sleep(10) ### Assure that queries are not too close in time. result = DAVIDQuery(type="UNIPROT_ACCESSION", annot=NULL, tool="geneReport") result$firstURL result$secondURL result$downloadURL result$DAVIDQueryResult ################################################### ### chunk number 3: chunk3 ################################################### #line 268 "vignettes/DAVIDQuery/inst/doc/DAVIDQuery.Rnw" Sys.sleep(10) ### Assure that queries are not too close in time. result = testGene2Gene(details=FALSE) length(result) names(result[[1]]) ################################################### ### chunk number 4: chunk4 ################################################### #line 278 "vignettes/DAVIDQuery/inst/doc/DAVIDQuery.Rnw" Sys.sleep(10) ### Assure that queries are not too close in time. affyToUniprot(details=FALSE) Sys.sleep(10) ### Assure that queries are not too close in time. uniprotToAffy(details=FALSE) ################################################### ### chunk number 5: sessionInfo ################################################### #line 329 "vignettes/DAVIDQuery/inst/doc/DAVIDQuery.Rnw" toLatex(sessionInfo())